海院科研动态（4）| 高质量中华白海豚基因组图谱发布

      中华白海豚是一种主要栖息于印度洋和西太平洋热带及亚热带近岸水域的小型鲸类。在中国，中华白海豚主要分布于福建厦门、台湾西海岸、广东珠江口、广东雷州湾、广西北部湾以及海南三亚水域，是我国国家一级保护物种，同时也是世界自然保护联盟红色名录中的“易危”物种，迫切需要对其自然群体进行保护。珠江口海域中华白海豚群体被认为是现存已知全球最大的中华白海豚群体，是中华白海豚重要的种质资源所在地，极具保护与研究价值。另外，与远洋鲸豚不同，中华白海豚生活在近岸浅海水域，相对独特的生活环境使其成为研究鲸类适应性进化的理想材料。

       我院吴玉萍教授团队和易梅生教授团队与华大海洋研究院合作，对中华白海豚进行了全基因组测序、组装和注释，首次组装出高质量的中华白海豚基因组图谱，基因组为2.3Gb，contig N50和scaffold N50分别达84.3kb和19.2Mb。将中华白海豚与其它哺乳动物进行系统发育分析的结果表明：在哺乳动物中，鲸类与偶蹄类具有较近的系统发育关系；在鲸类中，中华白海豚与瓶鼻海豚的亲缘关系最近，它们在约760万年前开始出现遗传分化（图1）。同时，本研究也通过比较基因组学发现中华白海豚和其它四种代表性哺乳动物（小须鲸、白暨豚、瓶鼻海豚和牛）体内均存在高度保守的降血压肽类物质（图2）。

      图1：系统发育分析

      图2：降血压肽类物质的高通量筛选

      本研究阐明了中华白海豚的适应性进化、系统发育以及历史种群动态特征，将为降血压肽类生物活性物质的高通量筛选以及相关心脑血管药物的研发提供遗传资源，为中华白海豚的遗传资源保存、物种保育及后续科学研究提供重要支撑。

      该研究结果发表在国际知名学术刊物《Marine Drugs》。新奥门31999新奥门31999贾坤同副教授与华大基因海洋研究院卞超副院长和易云海博士为该论文的共同第一作者，新奥门31999新奥门31999吴玉萍教授、易梅生教授与华大海洋研究院院长石琼教授为该论文的共同通讯作者。

      上述研究工作得到了国家自然科学基金、珠海市和深圳市科技计划项目等的资助。

原文链接：https://www.mdpi.com/1660-3397/17/9/504